Икономическата стагнация след спукването на икономическия балон в началото на 1990-те години, кара Япония да се съсредоточи върху регулаторната реформа като движеща сила за растеж. От средата на 1990-те години правителството предприема широка серия от мерки, насочени към насърчаване на регулаторна реформа в японските икономика, общество и правителство. Необходимостта от реформа е допълнително подчертана от основните промени, които настъпват в социално-икономическата среда през първите години на новото хилядолетие, промени, като например: дори по-бързо от очакваното застаряване на японското население, влошаване екологични проблеми, ускоряване на революцията в информационните технологии, както и развитието на индустриалната структура, породено от икономическата глобализация.

    През 1995 г. правителството формулира план за популяризиране на дерегулацията, който включва 1091 дерегулации в следните 11 категории: (1) земя и жилища (2) информация и комуникации; (3) разпределение; (4) транспорт; (5) стандарти , сертифициране и вноса; (6) финанси, ценни книжа и застраховане; (7) енергия; (8) заетост и труда (9) замърсяване, отпадъци и опазване на околната среда (10) опасни материали, защита при бедствия и публична безопасност; и (11) други. Този план е преработен през 1996 и 1997 г., като последната ревизия добави 12та категория - образование, и с което общият брой на елементите става 2823.

    С изтичането на периода, планиран от 1995 г., през 1998 г. правителството създава тригодишна програма за насърчаване на дерегулацията, която включва нови мерки, както и все още неприложените мерки от предишния план. Целите на този тригодишен план са да донесат драстична структурна реформа за японското общество и икономика, създаване на свободна и честна социално-икономическата система, която е напълно отворена към международната общност и се опира на правилата за личната отговорност и пазарните принципи, и изместването на акцента на публичната администрация от предварителните разпоредби към мониторинг за спазването на общите правила. Бяха добавени три нови категории - политики на конкурентоспособността, здравеопазването и благосъстоянието, и правни въпроси към вече съществуващите 12 категории от предишния план, и бяха определени общо 624 позиции. Тази тригодишна програма бе ревизирана през 1999 г. и 2000 г.

    През март 2001 г. правителството определя тригодишна програма за насърчаване на регулаторната реформа, като термина "дерегулиране" използван в предишни планове се заменя с "регулаторна реформа." Тази програма обхваща 554 регулаторни елементи в 15 специфични области, включително право, финанси, лекарства, медицински грижи, заетост, разпространение и енергетика. Той също така включва 104 междусекторни реформи покриващи области като информационните технологии, околната среда, конкурентоспособността, стандарти за сертифициране и квалификационни системи.

    През април 2001 г. Съветът за регулаторната реформа бе създаден като част от правителствения кабинет за да действа като консултативен орган на министър-председателя в продължение на три години. Първите два доклада, изготвени от съвета послужват като основа за ревизиите, които се правят на тригодишната програма през 2002 и 2003. Ревизираната програма от 2002 се фокусира върху шест области - медицински грижи, социални грижи и грижи за децата, заетостта, образованието, околната среда и градска реконструкция, докато ревизираната програма за 2003 включва нов акцент върху улесняване на създаването и оптимално използване на специални зони за структурната реформа. Окончателния доклад на Съвета, издаден през декември 2003 г., обобщава резултатите от последните усилия за реформи и излага проблемите, които да бъдат решени в бъдеще. От 2004 г., обсъждането на регулаторната реформа в рамките на правителството се извършва от Съвета за насърчаване на регулаторната реформа (2004 - 2007) и новия съвет за насърчаване на регулаторната реформа (2007-2010 г.). От март 2010 г., регулаторната и системната реформа се обработват от Комисията за правителството съживяване.

    Специални зони за структурната реформа са специално определени географски области, в които в резултат на прилагането на регулаторните изключения в съответствие с местните характеристики е възможно да се извършват дейности, които са забранени на национална основа от закони и наредби. Планове за тези дейности се изготвят по инициатива на местните власти и корпорации от частния сектор. Целите на зоните са съживяване на регионалните икономики чрез дерегулация и показване на успешни примери на структурната реформа за евентуално по-късно изпълнението на национална основа. Законопроектът за специални зони за структурната реформа бе приет през декември 2002 г., а системата влезе в сила през април 2003 г.. От юни 2011 г., правителството е одобрило общо 1155 на тези специални зони. Включени са специални зони за учебни заведения, в които частни корпорации могат да управляват специални училища и университети, селскостопански зони, в които частни корпорации могат да се занимават със земеделие, и специални международни зони за обмен, в които е олекотен визовия режим за чуждестранните изследователи.

    Регулаторната реформа в съобщителния сектор започва с приватизацията от 1985 г. на Nippon Telegraph Telephone (NTT), най-големият вътрешен оператор. Оттогава новосъздадените нови общи оператори (НОО) успях да си осигурят голям дял от пазара на комуникациите. Остра конкуренция между НОО, комбинирана с технологичните иновации, е допринесла за значителен спад в телефонните такси.

    Употребата на мобилни устройства претърпява бърз растеж през последното десетилетие. Системата за отдаване под наем на мобилни телефони се измества от директни продажби през 1994 г., а през 1996 г. правилата, касаещи въвеждането на нови тарифни планове за обслужване бяха облекчени. През 1998 г. процедурите за издаване на разрешителни за използването на мобилни телефони бяха значително опростени и таксите бяха намалени. Тези реформи доведоха до бум на мобилните комуникации, като броя на абонатите скача от 2,13 милиона през март 1994 г. до 119,53 милиона през март 2011 г..

    Както резултат на дерегулационните мерки през 1997 г., на NTT е позволено да стъпи на международния телефонен пазар и на Kokusai Denshin Denwa (KDD), основният международен оператор е позволено да влезе на вътрешния пазар. Правилата са изготвени за работа в мрежа и бе вдигната забраната за публично-частни-публични връзки. В допълнение, през 1998 г. наредбите по отношение на чуждестранната собственост бяха премахнати за главните телекомуникационни компании, с изключение на NTT и KDD. През юли 1999 г., NTT е разделена на две местни фирми, NTT Изток и NTT Запад и една фирма за дълги разстояния. Силната конкуренция, в резултат на дерегулацията продължава да стимулира реорганизацията в индустрията. Един пример за това е сливането на KDD и две НОО през октомври 2000 г. и формирането на корпорацията KDDI.

    Ръстът в използването на интернет за бизнес и в дома е друго развитие, подкрепено от дерегулацията в комуникационния бранш. Към декември 2009 г., броят на интернет потребителите възлиза на 94,080 милиона, или 78,0% от населението. Делът на домакинствата с широколентова интернет връзка е 76,1%. Степента на използване на оптични кабели е нараснала до 54,2%, тъй като все повече потребители да преминават на оптичен широколентов интернет.

    Преразглеждането на Закона за радиото и телевизията от 1999 г., позволява излъчването на различни видове данни като част от цифровия сигнал, дори и ако те не са свързани с изображението или звука на програмата. Цифровото разпространение на телевизионни и радио канали се въвеждат постепенно между 2003 и 2006. През юли 2011 г., аналогово телевизионно предаване приключи като нацията премина изцяло към цифрова наземна телевизия, с изключение на някои префектури в региона Тохоку, които бяха тежко засегнати от голямото земетресение в Източна Япония.

    Въз основа на концепцията за "свободен, честен и глобален", японското правителство осъществява радикални реформи на финансовия пазар, които са известни още като „Големия взрив”. Регулаторни реформи в този сектор са насочени към улесняване на участието на частни инвеститори в Япония. Изменение на Закона за ценните книжа и фондовите борси премахва бариерите между банкирането, ценните книжа и застрахователни области. По този начин се постига увеличаване на привлекателността, конкурентоспособността и жизнеността на пазара на ценни книжа. Вдигането на забраната за холдингови дружества разшири обхвата на операциите за търговските къщи и банки.;

    С промяната на Закона за контрол на валутата, която влезе в сила през април 1998 г., пазара на чуждестранните валути е напълно либерализиран. Това дава възможност на предприятията и физическите лица свободно да преговарят сделки и да уреждат сметките си със своите чуждестранни партньори. През декември 1998 г. бе изпълнена реформа на финансовата система, която включва разпоредби, дерегулиране фондовите комисии и общо застрахователните премии, премахване на ограниченията за директна продажба на ценни книжа и позволи на продажбите на инвестиционни продукти на доверие в банките. Регулаторните мерки за реформа, изпълнявани от 2001 г. насам, позволяват на банките да правят директни продажби на разнообразни застрахователни продукти.

    Закона за големи магазини за дребно е приет през 1974 за да защитава малките независими търговци на дребно. Неговите ограничения бяха облекчени в три ревизии, които са били направени през 1990-те години. Броят на заявленията за откриване на мащабни магазини скача от 794 през 1989 г. до 1667 през 1990 г., а през 1996 г. достига 2269. Нов закон бе написан през 1998 г. и влиза в сила през 2000 г. и измества фокуса от защита на съществуващите малки магазини към защита на местната среда за живеене.

    През 1996 г. бе променена системата за регулиране на продажбите на ориз от ограничен система към система за регистрация, в която всеки може да участва, а през 1999 г. бяха допълнително опростени процедурите за регистрация. Правилата, които обхващат предоставянето на лицензи за продажба на алкохол биват значително либерализиран през 1993 г., а през 2000 г. бяха премахнати и останалите критерии за населението и разстоянието. Общи фармацевтични стоки са били продавани в лицензирани аптеки, които работят с фармацевт, но през 1999 г. някои стоки, които преди са определени като лекарства, като витамини, биват категоризирани като „лекарствоподобни”, така че те да могат да се продават в дрогерии и други магазини, освен аптеки. Започвайки през 2009 г., е било позволено на фармацевтични продукти с нисък риск да се продават от регистрираните търговци, разширяване на гамата от фармацевтични продукти, продавани в супермаркети и магазини. Използването на помпи за самообслужване по бензиностанциите е разрешено през 1998 г.

    Регулациите за местните бизнес авиокомпании са преразгледани, особено тези, свързани с движението на търсенето и предлагането. Правилата за двойни и тройни писти бяха премахнати през април 1997 г., за да се насърчи конкуренцията между авиокомпаниите. Също така през 1997 г., нови компании бяха прибавени при увеличаване на слотовете за пристигане и заминаване са създадени от новата писта на летище Ханеда. В резултат две нови авиокомпании, Skymark Airlines и Air Do са в състояние да започнат полети през 1998 г.. От 2000 г. авиокомпаниите са в състояние да определят тарифи по свое усмотрение и това е води до въвеждането на различни планове в цената и цялостно намаление на тарифите.

    Обема за изграждане на многоетажни жилищни райони беше вдигнат и в измерването на обема за етажната собственост, стъпалата и коридори за общо ползване са отпаднали от елементите, които трябва да бъдат включени в обема. Тази мярка увеличава значително обема, който може да се използва за живеене. От 1998 г. преразглеждането на Закона за архитектурните стандарти позволява на определени частни организации да извършват строителни инспекции, изпълнявани преди това само от органите на местното управление.

    Инициативи за частния сектор са били въведени, включително и мерки, които позволяват включването на фирмите, предлагащи услуги и предоставят грижи за възрастните хора. В миналото, обществените услуги са били преобладаващи в тази област. Официалната система за ценообразуване на лекарствата също е ревизирана. От 2000 г. частните корпорации са в състояние да управляват детските заведения, докато преди само общините и социалните корпорации са имали такова разрешение.

    Регулаторните реформи, осъществени през 2000 г. разрешават лица без преподавателски опит или професионален опит в областта на образованието да бъдат наемани като директори в държавните училища. Това позволява на хора с широк спектър на умения от частния сектор да бъдат използвани в училищната системата. Следващите реформи облекчават изисквания за създаването на частни начални училища и прогимназиални, и улесняват кандидатстването на възпитаници на международните и етнически гимназии в Япония на изпитите за националните университети.